Microflora intestinala joaca un rol esential in sanatatea digestiva, fiind compusa dintr-o gama variata de microorganisme benefice. Acestea includ intre 300 si 1.000 de specii de bacterii, cea mai mare densitate gasindu-se in colon. Printre cele mai comune specii se numara Bacteroides, Clostridium, si Bifidobacterium, dintre care Bacteroides reprezinta aproximativ 30% din totalul microflorei. Aceste bacterii nu doar ca ajuta la fermentarea substantelor nedigerate, dar sunt si esentiale pentru imunitate, prevenind proliferarea agentilor patogeni, si contribuie la sinteza unor vitamine precum biotina si vitamina K, si a unor hormoni. Dezechilibrul microflorei poate avea consecinte grave, incluzand infectii si chiar contributia la dezvoltarea cancerelor digestive.